該研究團(tuán)隊(duì)的成果建立了人類細(xì)胞圖譜的基本框架。

近日，浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院干細(xì)胞與再生醫(yī)學(xué)中心郭國驥團(tuán)隊(duì)與浙江大學(xué)附屬醫(yī)院張丹團(tuán)隊(duì)、王偉林團(tuán)隊(duì)、陳江華團(tuán)隊(duì)、梁廷波團(tuán)隊(duì)和黃河團(tuán)隊(duì)等聯(lián)合在《Nature》上發(fā)表研究成果，該成果名為“Construction of a Human Cell Landscape at Single-cell Level”，論文顯示該團(tuán)隊(duì)成功繪制了世界首個(gè)人類細(xì)胞圖譜。

圖 | 一張單細(xì)胞水平的人類細(xì)胞圖譜

據(jù)了解，該研究團(tuán)隊(duì)對(duì)60種人體組織樣品和7種細(xì)胞培養(yǎng)樣品進(jìn)行了Microwell-seq高通量單細(xì)胞測(cè)序分析，系統(tǒng)性地繪制了跨越胚胎和成年兩個(gè)時(shí)期，涵蓋八大系統(tǒng)的人類細(xì)胞圖譜。

研究過程中，團(tuán)隊(duì)已經(jīng)建立了70多萬個(gè)單細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫，并鑒定了人體100余種細(xì)胞大類和800余種細(xì)胞亞類。同時(shí)，他們也開發(fā)了scHCL單細(xì)胞比對(duì)系統(tǒng)用于人體細(xì)胞類型的識(shí)別，搭建了人類細(xì)胞藍(lán)圖網(wǎng)站。

通過這一研究，團(tuán)隊(duì)建立了人類細(xì)胞圖譜的基本框架，發(fā)現(xiàn)成人非免疫細(xì)胞的廣泛免疫激活，提出內(nèi)干細(xì)胞和祖細(xì)胞的分化過程是一個(gè)細(xì)胞基因表達(dá)從混亂到有序的過程，并認(rèn)為基因組中的調(diào)節(jié)子預(yù)先決定了分化終端的穩(wěn)定狀態(tài)。

針對(duì)圖譜對(duì)醫(yī)學(xué)臨床的幫助，郭國驥表示，“我們現(xiàn)在建立的是正常細(xì)胞的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的數(shù)據(jù)庫，可以用于再生醫(yī)學(xué)種子細(xì)胞的鑒定。未來如推廣到疾病細(xì)胞圖譜，便有可能運(yùn)用到疾病的單細(xì)胞水平診斷上。細(xì)胞圖譜的數(shù)據(jù)對(duì)于理解疾病的發(fā)生有重要意義，但臨床治療方面的應(yīng)用尚需要更多的積累。”

另外圍繞成果本身，郭國驥也說到，“我們的工作在測(cè)序深度和細(xì)胞數(shù)目上都存在局限性，但是在跨組織和跨物種的數(shù)據(jù)可比性上有較大優(yōu)勢(shì)。完美版的人類細(xì)胞圖譜還應(yīng)該整合空間信息、多組學(xué)數(shù)據(jù)和人群分析，這需要全世界科學(xué)家的共同努力。”

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