劍橋研究學(xué)者為基因突變過程“建?!?,或?qū)⑼品_爾文的隨機突變理論

巫盼 8年前 (2017-08-21)

科學(xué)家對生物基因的突變原因的探索,將會推動未來癌癥治療領(lǐng)域的進步。

劍橋研究學(xué)者為基因突變過程“建?!保?qū)⑼品_爾文的隨機突變理論

近日,劍橋巴布拉罕研究所分子生物學(xué)和遺傳學(xué)專家Jonathan Houseley領(lǐng)導(dǎo)的一個研究小組提出,在酵母研究上,研究人員可以控制酵母基因組的基因突變,尤其是對基因組中具有很強適應(yīng)能力的基因的控制。

背景

在遺傳學(xué)研究領(lǐng)域,進化生物學(xué)家對突變的解釋各執(zhí)一詞,有人表示,突變只是生物在進化過程中自我修復(fù)后遺留的些微次要結(jié)果;而另有一些研究人員表示,突變率本身的增加是一種演變的結(jié)果,有助于生物在壓力環(huán)境下更快地形成有利于生存的特性。

在眾多實驗室的研究中,出于由簡至繁的研究思路考慮,研究人員采取的研究對象都為單細(xì)胞生物。

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說到生物學(xué)上的突變,不得不提到1944年的一件小事,當(dāng)時哥倫比亞大學(xué)遺傳學(xué)博士生Evelyn M. Witkin偶然間犯了一個錯誤,她在紐約冷泉港實驗室的第一次實驗中,不小心將紫外線光調(diào)至過亮,以導(dǎo)致數(shù)百萬的大腸桿菌死亡。但當(dāng)她檢查培養(yǎng)基時,其中有一個培養(yǎng)基,里面有四個大腸桿菌存活了下來并在繼續(xù)生長。

接下來的二十年間,Witkin一直在研究這些突變體什么時候出現(xiàn)以及為什么出現(xiàn),因此Witkin在SOS反應(yīng)的相關(guān)研究上獲得了一定的成就,但她尚未解決最初提出的問題。

其中,SOS反應(yīng),又稱應(yīng)激反應(yīng),由克羅地亞人 Miroslav Radman 在1975年發(fā)現(xiàn)和命名,是指染色體DNA受到嚴(yán)重?fù)p傷時細(xì)胞做出的應(yīng)激反應(yīng)。

當(dāng)DNA分子嚴(yán)重?fù)p傷時,正常的復(fù)制和修復(fù)系統(tǒng)無法完成DNA的復(fù)制,此時會啟動應(yīng)急反應(yīng)。在這種情況下,多種基因被誘導(dǎo)表達,其中1個拷貝的UmuC和2個拷貝的被截短的UmuD主要組成 DNA聚合酶Ⅴ,后者可在DNA模板有切口的區(qū)域催化DNA復(fù)制。

SOS反應(yīng)包括誘導(dǎo)DNA損傷修復(fù)、誘變效應(yīng)(在DNA受到損傷或復(fù)制系統(tǒng)受到抑制的緊急情況下,生物發(fā)生突變將有利于其生存)等。該現(xiàn)象廣泛存在于原核和真核生物中,主要包括DNA的修復(fù)和產(chǎn)生變異。

一直以來,科學(xué)家們努力探尋,但始終無法得出生物出現(xiàn)突變的原因,更不敢妄想對基因的突變過程進行控制。

突破

此次,不同于其他人提出的“突變是隨機的”等宏大的研究觀點,Houseley選擇采用定性加定量的方式,對特定種類的突變體進行研究和控制。

2015年,在酵母細(xì)胞的研究上,Houseley及其研究團隊發(fā)現(xiàn),酵母細(xì)胞正在驅(qū)動核糖體的部分基因拷貝數(shù)的變異。雖然研究團隊表示尚無法證明這種變異是細(xì)胞對環(huán)境變化的有針對性的適應(yīng)性反應(yīng),然而他們發(fā)現(xiàn),當(dāng)環(huán)境中的營養(yǎng)物質(zhì)豐富時,且蛋白質(zhì)需求更高時,酵母細(xì)胞會催生更多的核糖體基因拷貝。

因此,Houseley制造了相似的環(huán)境機制,以檢測該環(huán)境是否會讓酵母細(xì)胞有類似的行為。

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Houseley

實驗中,研究團隊專注研究基因CUP1,該基因可以幫助酵母細(xì)胞抵制環(huán)境中銅的毒性對其的傷害。結(jié)果發(fā)現(xiàn),隨著環(huán)境中銅的增加,細(xì)胞中的CUP1基因的拷貝數(shù)會增加。但總體來看,大多數(shù)細(xì)胞的基因拷貝數(shù)的增加量沒有太大變化,有明顯變化的酵母細(xì)胞數(shù)約占總數(shù)的10%。

但研究團隊表示,這個實驗也許只是巧合,并不能證明一定是環(huán)境中的銅引起該基因的突變。

為了讓環(huán)境中特定因素可以引發(fā)突變這一猜想成為必要條件,研究人員巧妙得設(shè)計了一種新型的CUP1,使其只受半乳糖影響。實驗結(jié)果表明,該新型基因的拷貝數(shù)隨著環(huán)境中半乳糖的量的變化而變化,這一發(fā)現(xiàn)也并非巧合。

推進

目前,在已有的基因工程研究中,突變過程的機理一致被認(rèn)為是:當(dāng)細(xì)胞在進行DNA復(fù)制時,突變基因的拷貝會停止。而通常停止后會重新開始,即便不能重新開始,該拷貝過程也會接著已有的部分繼續(xù)拷貝,但在這種情況下,細(xì)胞有時會意外刪除基因序列或者拷貝過多。

故而,現(xiàn)有的實驗室研究團隊一致認(rèn)為是基因組中基因位置的變化直接導(dǎo)致了細(xì)胞的重大變異。

劍橋研究學(xué)者為基因突變過程“建模”,或?qū)⑼品_爾文的隨機突變理論

但是,Houseley和他的團隊認(rèn)為,雖然這些因素的組合影響使得大家認(rèn)為拷貝過程中的錯誤是影響到基因變異的主要因素,但其實這一現(xiàn)象實質(zhì)上更有可能是在說明,拷貝數(shù)是影響突變的主要因素。

不過對于這一猜想,研究團隊尚在研究證明中。

Houseley表示,我們的研究就是基于達爾文提出的隨機突變,找到影響突變的確切因素,定量分析和引導(dǎo)基因的突變。

總結(jié)

對于Houseley的工作,賓夕法尼亞大學(xué)的生物學(xué)家Paul Sniegowski評價道:“他的工作與該領(lǐng)域的適應(yīng)性突變爭議相關(guān),試著定量分析來證明突變這一不確定現(xiàn)象的確定控制因素是非常棒的想法。但是要想挑戰(zhàn)傳統(tǒng)的進化理論,他們還需做大量的測試,通過創(chuàng)建一個理論模型來表明突變的演化過程。”

對此,Houseley表示,正在努力,研究階段尚處于早期階段。

雖然尚處于嘗試證明階段,但Houseley的想法十分大膽,若研究成功,未來將會改寫現(xiàn)有的進化理論,也為未來基因研究、醫(yī)學(xué)治療等方面,尤其是癌癥的控制治療,帶來無法想象的顛覆。

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