圣誕樹背后的故事:生物學家花了40年時間,只為通過基因工程培育完美圣誕樹

Lynn 8年前 (2017-12-23)

絢麗的圣誕樹背后,是滿滿的學問與難題。

今天,打開朋友圈,莫名其妙刷到一堆人艾特微信官方,表示要戴圣誕帽……

圣誕樹背后的故事:生物學家花了40年時間,只為用基因測序培育完美圣誕樹

更有甚者開始向微信要圣誕樹……

圣誕樹背后的故事:生物學家花了40年時間,只為用基因測序培育完美圣誕樹

不過,想要圣誕樹的【壞笑】,你來對了地方,接下來鎂客君帶你看遍萬種圣誕樹。

關(guān)于挑選圣誕樹,你不知道的那些事

作為和鎂客君一樣熱愛傳統(tǒng)文化的你,是不是也以為圣誕樹只有一種:松樹?

No!很多樹都可以用來作圣誕樹,其中常被使用的樹的品種包括松柏類(松科、杉科、柏科和南洋杉科的統(tǒng)稱)、松科冷杉屬、云杉屬和松屬。

其實關(guān)于圣誕樹,里面的學問可多著呢!今天鎂客君就帶大家一起了解下來龍去脈。

圣誕樹背后的故事:生物學家花了40年時間,只為用基因測序培育完美圣誕樹

圣誕節(jié)是歐美的新年節(jié)日,其重要性也就等同于我們的“春節(jié)”,所以在挑選圣誕樹這件事上,他們要比我們用心的多。

一般圣誕節(jié)前一星期,家里的爸爸們就會根據(jù)客廳的大小、預算、家人的喜好(樹的顏色、氣味、高矮胖瘦)、要掛多少裝飾等因素,開始去店里或莊園買圣誕樹,買來的圣誕樹一般都是砍下來的,也有可能是盆栽。買回來一般是要在家里放上兩到三個星期的。

因為要在家里放上一段時間,這棵樹帶給他們的除了快樂,還有煩惱。

你想想看,隨著家中圣誕樹擺放的時間越長,樹上針形葉脫落的情況就越嚴重。并且,因為圣誕樹是從外面的寒冷之地移到溫暖的室內(nèi),自身的新陳代謝會受到很大的影響,從而隨著放置時間的變長,顏色也會改變。

這樣,在圣誕節(jié)前后長達半月的假日里,怎樣保持家中圣誕樹的美觀和整潔就成了一個問題。(對于不愿打理的懶人來說尤其重要?。?/p>

一樹難求!科學家用基因測序等生物學工具來培育“完美”圣誕樹

綜合各種需求,想要挑選一棵稱心如意的樹并不容易:

圣誕樹背后的故事:生物學家花了40年時間,只為用基因測序培育完美圣誕樹

圣誕樹背后的故事:生物學家花了40年時間,只為用基因測序培育完美圣誕樹

圣誕樹背后的故事:生物學家花了40年時間,只為用基因測序培育完美圣誕樹

由上圖可以看出,圣誕樹種類真的很多,并且不同種類的樹之間,顏色、氣味和形狀的差別還是很明顯的,當然在挑選時一定需要注意的是:葉片脫落和顏色變化情況。

以美國常用圣誕樹為例,見下表:

圣誕樹背后的故事:生物學家花了40年時間,只為用基因測序培育完美圣誕樹

除了形狀、氣味之外,有的樹顏色會變化,還有個別樹具有很長時間的留針能力。

但顏色好看的卻多數(shù)都沒有頑強的生命力。

為了消除樹自身特有的缺陷,將眾多樹公認的優(yōu)點集于一身,科學家決定利用基因測序和基因計算等生物學工具,以輔助培育出堪稱完美的圣誕樹。

雖然鎂客君簡單總結(jié)為“完美”二字,但是要做到完美,科學家要完成一個巨大的工程?。。?/p>

四十年研究不輟,不完美問題遲遲未被解決:痛點在基因數(shù)據(jù)收集

據(jù)生物學家研究,圣誕樹的種類只是以科、屬分類,就已有七種,每一科(屬)下還有至少數(shù)十種樹,考慮到地區(qū)等差異,類別劃分至少要達到上百種。

為了研究它們各自的特征,自1978年以來,華盛頓州立大學的Gary Chastagner就開始每年在圣誕樹種植莊園和各類零售店游走、拍照和咨詢,并把各類圣誕樹的枝條剪下帶回去嫁接和研究。

和北卡羅來納州立大學的研究合作者John Frampton一起,他們利用特有的轉(zhuǎn)錄RNA,將收集的DNA轉(zhuǎn)化為蛋白質(zhì),從而找出對應于每一種特征的相關(guān)基因。

歷經(jīng)四十余年,他們從世界各地數(shù)百棵圣誕樹中采集篩選了1200千兆字節(jié)的基因數(shù)據(jù)作為基本的樣本數(shù)據(jù)。如今,康涅狄格大學的計算生物學家Jill Wegrzyn將對收集的數(shù)據(jù)進行分析。對于這一工作,Wegrzyn表示:“我們正在對基因列表進行一些序列上的調(diào)整,并且試圖將它們組合在一起,以得到不同組合情況下的基因表達。不過這不是一件容易的事,尤其對松柏科植物來說。

圣誕樹背后的故事:生物學家花了40年時間,只為用基因測序培育完美圣誕樹

為什么難度這么高?

不像玉米或大豆等植物,松柏類植物基因組大約有20億,是人類基因數(shù)據(jù)的7倍,所以想要獲得它們的全套基因數(shù)據(jù),研究人員需要花費大量的時間、金錢和精力來檢測和篩選。此外,Chastagner在收集基因數(shù)據(jù)的過程中,同時觀察和記錄了第10天、第20天和第30天的細胞分裂狀況與基因表達之間的關(guān)系。

關(guān)于這一絕不輕松的任務,Wegrzyn表示,這1200千兆字節(jié)基因數(shù)據(jù)的處理,大約需要他花費5年的時間。

圣誕樹的變身:量子計算或可為其提供新的轉(zhuǎn)機

對于改進圣誕樹這一研究,Chastagner表示:“這些物種的遺傳改良潛力巨大,但實際情況是,使用基因工程對其進行改進,技術(shù)本身的復雜性是我們研究的阻礙。”所以要想研制出“完美”的圣誕樹,還需至少幾年。

不過鎂客君覺得,既然AI是數(shù)據(jù)處理的引擎,而基因數(shù)據(jù)也是一種數(shù)據(jù),所以AI或可為其解決難題。只是現(xiàn)在的難點在于,怎么將基因數(shù)據(jù)存儲在計算機里?或許量子計算機是必由之路了。

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